6月14日0-24时，深圳新增3例境外输入确诊病例，3例境外输入确诊病例为中国籍，男性，从南非抵深。入境后即被集中隔离，后转至深圳市第三人民医院应急院区观察治疗，情况稳定。
6月11日0-24时，深圳新增1例境外输入确诊病例和4例境外输入无症状感染者。1例境外输入确诊病例为中国籍，男性，从南非抵深。入境后即被集中隔离，后转至深圳市第三人民医院应急院区观察治疗，情况稳定。3例境外输入无症状感染者为中国籍，1男2女从南非抵深。
据航空公司消息，6月16日、23日、30日和7月7日的航班熔断取消。
| 起运港 | 目的港 | 船公司 | 20GP | 40GP | 40HC | 有效期 | 详情 |
| 蛇口,深圳 | 伊丽莎白港 | MSC | 1840 | 4680 | 4680 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 盐田,深圳 | 开普敦 | MSC | 2100 | 2250 | 2250 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 盐田,深圳 | 德班 | MSC | 2100 | 2250 | 2250 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 盐田,深圳 | 库哈 | MSC | 2100 | 2250 | 2250 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 蛇口,深圳 | 库哈 | MSC | 2100 | 2250 | 2250 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 蛇口,深圳 | 开普敦 | MSC | 2100 | 2250 | 2250 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 蛇口,深圳 | 德班 | MSC | 2100 | 2250 | 2250 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 蛇口,深圳 | 德班 | ONE | 2190 | 2780 | 2780 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 盐田,深圳 | 德班 | ONE | 2240 | 2880 | 2880 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
| 盐田,深圳 | 东伦敦 | MSC | 2525 | 2975 | 2975 | 2025-06-13-2025-07-14 | 详情 |
